26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0991 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0362  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 449 aa  914    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0991  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 449 aa  914    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3318  HK97 family phage major capsid protein  56.74 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0235436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2067  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  56.51 
 
 		 433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1682  HK97 family phage major capsid protein  43.86 
 
 		 418 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  42.89 
 
 		 396 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1668  phage major capsid protein, HK97  42.75 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0649  Phage major capsid protein, HK97  40.36 
 
 		 465 aa  296  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296668  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1600  phage major capsid protein, HK97 family  42.76 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2963  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  43.87 
 
 		 396 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  39.95 
 
 		 405 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1634  major head protein  43.97 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  42.09 
 
 		 414 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0642  phage major head protein  41.71 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  42.86 
 
 		 418 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  33.67 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3943  HK97 family phage major capsid protein  32.19 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  35.41 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0461  major phage capsid subunit precursor  29.06 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.561977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3892  hypothetical protein  31.58 
 
 		 421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0353742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  24.83 
 
 		 579 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3892  putative phage head  26.82 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  25.8 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  27.32 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2837  hypothetical protein  23.17 
 
 		 352 aa  53.5  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0998237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  25.73 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>