More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0775 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0775  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 119 aa  230  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.292736  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0301  50S ribosomal protein L18  84.87 
 
 		 119 aa  203  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0607  50S ribosomal protein L18  83.19 
 
 		 119 aa  199  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0270  50S ribosomal protein L18  79.83 
 
 		 119 aa  188  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0524919  normal  0.432762 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1731  50S ribosomal protein L18  79.83 
 
 		 119 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00463126  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0377  50S ribosomal protein L18  79.83 
 
 		 119 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2518  50S ribosomal protein L18  78.15 
 
 		 119 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  60.17 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  60.17 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  64.29 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  61.26 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  61.26 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  55.08 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  60.17 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  64.49 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  62.5 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  59.09 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  60.36 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 		 120 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1972  50S ribosomal protein L18  63.37 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000177032  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  51.28 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  52.73 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2802  50S ribosomal protein L18  63.72 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.449731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  58.93 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  64.52 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  67.01 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1180  50S ribosomal protein L18  61.39 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  52.07 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  57.39 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  65.98 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  54.62 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  55.83 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  55.65 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1217  50S ribosomal protein L18  60.4 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  64.95 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  64.95 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1265  50S ribosomal protein L18  63.25 
 
 		 116 aa  117  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  52.17 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0210  LSU ribosomal protein L18P  58.95 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0545165  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  51.64 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  51.35 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  59.05 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  52.1 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  52.1 
 
 		 134 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1060  50S ribosomal protein L18  59.14 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172408  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  50.85 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  51.28 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1031  50S ribosomal protein L18  59.14 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295773  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1048  50S ribosomal protein L18  59.14 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00198535  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  52.1 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  62.5 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  51.72 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  51.33 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 124 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  47.06 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  51.79 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  57.29 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  49.17 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>