29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2827 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2827  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  724    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  29.82 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  30.57 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  28.01 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  28.61 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0930  hypothetical protein  27.01 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0087813  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  25.15 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  26.01 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  28.02 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  27.11 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  31.96 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  31.96 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  24.64 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  28.12 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3484  hypothetical protein  25.42 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  29.63 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  25.77 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3016  hypothetical protein  23.26 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 949 aa  57.4  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  27.16 
 
 		 338 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  28.37 
 
 		 870 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  24.66 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  22.56 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1192  hypothetical protein  20.48 
 
 		 447 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  23.24 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  30.22 
 
 		 886 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  22.3 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  28.87 
 
 		 846 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  26.89 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>