18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0930 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0930  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  648    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0087813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2827  hypothetical protein  27.01 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  27.73 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  30.19 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  25.64 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  28.71 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  27.67 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  29.91 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  26.57 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  25.97 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  24.26 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  28.21 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  34.68 
 
 		 445 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  27.88 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6142  hypothetical protein  33.83 
 
 		 192 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  28.44 
 
 		 366 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  32.63 
 
 		 870 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>