More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2004 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 		 312 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.29 
 
 		 314 aa  461  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.7 
 
 		 316 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.38 
 
 		 316 aa  455  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.15 
 
 		 314 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.75 
 
 		 316 aa  454  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.38 
 
 		 314 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.63 
 
 		 314 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.58 
 
 		 321 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.62 
 
 		 316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.31 
 
 		 312 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.9 
 
 		 321 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.16 
 
 		 315 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.9 
 
 		 321 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.16 
 
 		 315 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.22 
 
 		 316 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.26 
 
 		 321 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.81 
 
 		 310 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  60.26 
 
 		 313 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.34 
 
 		 315 aa  394  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.9 
 
 		 312 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 		 323 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.94 
 
 		 313 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0607  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.66 
 
 		 315 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0588  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.34 
 
 		 315 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.94 
 
 		 313 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.5 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.06 
 
 		 318 aa  392  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.58 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.74 
 
 		 318 aa  391  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.06 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 		 313 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.34 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.87 
 
 		 310 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.94 
 
 		 313 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.66 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.87 
 
 		 310 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.97 
 
 		 312 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.87 
 
 		 310 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  62.66 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.74 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.74 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.09 
 
 		 318 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.22 
 
 		 313 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.87 
 
 		 310 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  61.09 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.09 
 
 		 315 aa  388  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.7 
 
 		 315 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.74 
 
 		 316 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.34 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.09 
 
 		 320 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.58 
 
 		 316 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.54 
 
 		 317 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00466763  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.94 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.02 
 
 		 315 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.7 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.09 
 
 		 320 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.74 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.09 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.09 
 
 		 320 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.09 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.74 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.98 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000456755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04542  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.94 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.46 
 
 		 311 aa  381  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.84 
 
 		 316 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.38 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.38 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.77 
 
 		 318 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.77 
 
 		 318 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.77 
 
 		 318 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.45 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.77 
 
 		 318 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.38 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.13 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.45 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60 
 
 		 313 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.65 
 
 		 311 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.45 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.38 
 
 		 314 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.45 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0673  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.45 
 
 		 314 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000671501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.38 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.71 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.98 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0575408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.38 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.68 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.77 
 
 		 318 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.91 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.13 
 
 		 332 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.38 
 
 		 315 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.38 
 
 		 315 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.94 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.94 
 
 		 320 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.77 
 
 		 318 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.77 
 
 		 318 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  61.09 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.38 
 
 		 315 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>