More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1056 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 311 aa  627  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04542  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.24 
 
 		 319 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.63 
 
 		 318 aa  475  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.31 
 
 		 312 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.31 
 
 		 311 aa  471  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.31 
 
 		 318 aa  471  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697734  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.68 
 
 		 322 aa  471  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0575408  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.36 
 
 		 322 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000456755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.7 
 
 		 336 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.03 
 
 		 318 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.58 
 
 		 316 aa  455  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.49 
 
 		 313 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.45 
 
 		 316 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.26 
 
 		 315 aa  450  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.45 
 
 		 316 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.45 
 
 		 316 aa  441  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0726  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.04 
 
 		 319 aa  441  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282105  normal  0.258423 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.03 
 
 		 315 aa  441  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.03 
 
 		 315 aa  441  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.28 
 
 		 313 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.61 
 
 		 313 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.28 
 
 		 313 aa  434  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.61 
 
 		 313 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.96 
 
 		 313 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.96 
 
 		 310 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.96 
 
 		 310 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.28 
 
 		 313 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.21 
 
 		 315 aa  431  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.49 
 
 		 316 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.21 
 
 		 315 aa  431  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.96 
 
 		 310 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.49 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.31 
 
 		 310 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.49 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.96 
 
 		 310 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.17 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.49 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.49 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.49 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.49 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.17 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.03 
 
 		 325 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  67.64 
 
 		 313 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.38 
 
 		 324 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.49 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.17 
 
 		 320 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.67 
 
 		 324 aa  428  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.17 
 
 		 320 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.88 
 
 		 316 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.85 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.52 
 
 		 316 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.85 
 
 		 318 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.27 
 
 		 323 aa  424  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.52 
 
 		 316 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.17 
 
 		 320 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.52 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.52 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.06 
 
 		 321 aa  421  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.99 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.52 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.2 
 
 		 318 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.88 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  65.06 
 
 		 321 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2105  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.34 
 
 		 318 aa  420  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  65.06 
 
 		 319 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.31 
 
 		 320 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.74 
 
 		 324 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.16 
 
 		 319 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.92 
 
 		 311 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  63.75 
 
 		 321 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.96 
 
 		 315 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.96 
 
 		 324 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.94 
 
 		 314 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.61 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.29 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.61 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.96 
 
 		 324 aa  411  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.29 
 
 		 315 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.29 
 
 		 315 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.29 
 
 		 315 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.61 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.64 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.96 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3130  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.64 
 
 		 324 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268526  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0607  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.67 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0588  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.67 
 
 		 315 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.29 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.64 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.29 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.96 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.64 
 
 		 315 aa  407  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.64 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.96 
 
 		 315 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.96 
 
 		 315 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.64 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.29 
 
 		 315 aa  407  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.64 
 
 		 315 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.99 
 
 		 314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.96 
 
 		 315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.38 
 
 		 321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>