More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0094 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 
250 aa  493  1e-138  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.15 
 
 
324 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.26 
 
 
264 aa  212  4e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.94 
 
 
253 aa  209  3e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  41.8 
 
 
251 aa  207  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  41.87 
 
 
247 aa  206  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.4 
 
 
257 aa  205  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.30103e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  46.61 
 
 
368 aa  205  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.03 
 
 
252 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  40 
 
 
247 aa  202  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.44 
 
 
257 aa  200  2e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  42.02 
 
 
271 aa  195  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  42.22 
 
 
241 aa  191  7e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.28 
 
 
468 aa  188  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  40.17 
 
 
245 aa  188  9e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  42.24 
 
 
266 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  40.17 
 
 
245 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  40.17 
 
 
245 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41 
 
 
257 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.06 
 
 
254 aa  181  8e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.36 
 
 
268 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  39.36 
 
 
268 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  41.7 
 
 
259 aa  179  3e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  41.7 
 
 
259 aa  179  3e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  41.7 
 
 
259 aa  179  3e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  41.7 
 
 
259 aa  179  3e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  41.7 
 
 
259 aa  179  3e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  42.51 
 
 
258 aa  179  5e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.51 
 
 
258 aa  179  5e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  42.51 
 
 
258 aa  179  5e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  42.51 
 
 
258 aa  179  5e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  42.51 
 
 
258 aa  179  5e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  42.51 
 
 
258 aa  179  5e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  42.51 
 
 
258 aa  179  5e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  42.51 
 
 
258 aa  179  5e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  42.51 
 
 
258 aa  179  5e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  40.41 
 
 
266 aa  179  5e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  40.41 
 
 
266 aa  179  5e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  38.78 
 
 
264 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40 
 
 
275 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  39.42 
 
 
269 aa  175  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  40.82 
 
 
262 aa  174  1e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.82 
 
 
275 aa  173  2e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 
259 aa  173  2e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  5.557e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  37.31 
 
 
263 aa  173  3e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  38.82 
 
 
270 aa  172  4e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.25 
 
 
260 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.37 
 
 
268 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  38.62 
 
 
267 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.37 
 
 
263 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  38.62 
 
 
267 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.3 
 
 
274 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.58 
 
 
264 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  40.16 
 
 
251 aa  169  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.8 
 
 
262 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.8 
 
 
262 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.31 
 
 
251 aa  168  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  38.52 
 
 
251 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  41.67 
 
 
265 aa  166  3e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  35.77 
 
 
250 aa  166  4e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  38.02 
 
 
249 aa  165  6e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  38.14 
 
 
244 aa  165  7e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.09 
 
 
262 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.31 
 
 
368 aa  164  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  35.6 
 
 
271 aa  164  1e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  37.34 
 
 
249 aa  164  1e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.8 
 
 
262 aa  163  2e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.91 
 
 
258 aa  164  2e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  38.8 
 
 
262 aa  163  2e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  41.7 
 
 
256 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  35.66 
 
 
257 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  40.17 
 
 
323 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.83 
 
 
252 aa  162  4e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  40.08 
 
 
288 aa  162  4e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.14 
 
 
263 aa  162  4e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.2 
 
 
262 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.51 
 
 
250 aa  161  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.43 
 
 
255 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.55 
 
 
253 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  39.33 
 
 
255 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.89 
 
 
259 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  38.4 
 
 
262 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.26 
 
 
263 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.27 
 
 
264 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3373  Sec-independent protein translocase TatC  41.34 
 
 
275 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.09 
 
 
258 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.09 
 
 
258 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.32 
 
 
241 aa  160  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  39.91 
 
 
250 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.75 
 
 
264 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
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NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  33.91 
 
 
230 aa  158  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40 
 
 
253 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.76 
 
 
263 aa  158  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008752  Aave_1055  Sec-independent protein translocase TatC  39.6 
 
 
265 aa  158  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_002978  WD0452  MttB family protein  35.66 
 
 
253 aa  158  7e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0741  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.23 
 
 
258 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.68 
 
 
258 aa  158  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.17 
 
 
398 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  36.63 
 
 
289 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.63 
 
 
289 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
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