38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4194 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  720    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  49.23 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  45.21 
 
 		 308 aa  282  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 		 339 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  35.6 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  37.81 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  34.96 
 
 		 317 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  36.71 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  36.44 
 
 		 342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  31.27 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  36.63 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  35.96 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  34.25 
 
 		 188 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  30.54 
 
 		 223 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  29.33 
 
 		 172 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  26.05 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  27.78 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  27.22 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  26.95 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  25.79 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  26.11 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  26.05 
 
 		 231 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  27.97 
 
 		 164 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1490  peptidase C39, bacteriocin processing  24.64 
 
 		 199 aa  47.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2240  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1400 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3132  tetratricopeptide repeat protein  31.93 
 
 		 1400 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0761546 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2185  tetratricopeptide repeat protein  31.93 
 
 		 1400 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2200  tetratricopeptide repeat protein  29.25 
 
 		 1400 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228728 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2322  tetratricopeptide repeat protein  31.93 
 
 		 1400 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1976  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1400 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1994  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1400 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2025  hypothetical protein  29.25 
 
 		 666 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.29 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>