51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1734 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1734  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  566  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.264913  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0564  ribokinase-like domain-containing protein  55.29 
 
 		 256 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000354335 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1743  kinase  57.2 
 
 		 255 aa  292  5e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.11698 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1554  ribokinase-like domain-containing protein  55.69 
 
 		 256 aa  291  6e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0398  ribokinase-like domain-containing protein  28.7 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.688788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  35.19 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  39.44 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  24.81 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  32.41 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  32.17 
 
 		 320 aa  48.9  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  24.81 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  28.85 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  28.85 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  28.85 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  28.85 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  28.85 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  45.45 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2948  ribokinase-like domain-containing protein  25.41 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  41.27 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  30.58 
 
 		 332 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0161  fructose-1-phosphate kinase-like protein  25.62 
 
 		 276 aa  45.8  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.011677  unclonable  2.34449e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1424  PfkB domain protein  27.35 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  35.9 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  26.22 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  35.62 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  32.56 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  34.25 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  22.97 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  29.7 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  37.18 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  34.43 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  40 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  42 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  25.6 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  27.39 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  26.47 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  41.07 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0505  ribokinase-like domain-containing protein  24.59 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000868793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  31.65 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  24.03 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  38.27 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  36.67 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  24.91 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1429  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 272 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  35.94 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0922  ribokinase-like domain-containing protein  23.17 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  24.74 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  42.03 
 
 		 300 aa  42  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 316 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3082  PfkB domain protein  24.02 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.925823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>