241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0161 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0161  fructose-1-phosphate kinase-like protein  100 
 
 		 276 aa  553  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.011677  unclonable  2.34449e-28 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0148  fructose-1-phosphate kinase-like protein  35.47 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000234171 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  29.8 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  30.67 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  30.67 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  31.14 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  30.3 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  27.99 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  29.57 
 
 		 312 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  30.96 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  26.47 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  29.17 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  29.13 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  29.13 
 
 		 312 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  26.8 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  27 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  29.86 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  28.26 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  28.7 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  27.37 
 
 		 302 aa  96.7  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  29.13 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  28.37 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  28.95 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl180  1-phosphofructokinase  29.69 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  25.57 
 
 		 303 aa  95.5  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  27.76 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  25.57 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  28.26 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  26.21 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  26.45 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  26.45 
 
 		 303 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  31.08 
 
 		 302 aa  92.8  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  29.66 
 
 		 304 aa  92.4  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  28.26 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  28.26 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  28.91 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  28.26 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  25.57 
 
 		 303 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  25.57 
 
 		 303 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  25.57 
 
 		 303 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  25.24 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  25.24 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0619  1-phosphofructokinase  30.28 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.502151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1735  1-phosphofructokinase  28.76 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  27.18 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0852  1-phosphofructokinase, putative  26.52 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.810869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  28.22 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  25.96 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  29.23 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  29.02 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0322  1-phosphofructokinase  25.66 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000799963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  27.52 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  29.71 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  28.63 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  29.67 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  25.86 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  26.32 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  28.09 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  26.33 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  25.18 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  28.52 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  26.99 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  29.6 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  28.51 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  26.05 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  25.21 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  25.24 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  30.3 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  30.3 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  24.79 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  24.91 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  25.9 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  26.16 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  27.48 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  29.41 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  24.15 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  26.51 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  25.72 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1103  1-phosphofructokinase  27.05 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  23.73 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  26.45 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  25.7 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  22.98 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  25.3 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  26.69 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>