73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2726 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  82.63 
 
 
236 aa  407  1e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  70.34 
 
 
236 aa  351  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  64.83 
 
 
232 aa  316  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  61.44 
 
 
236 aa  304  9e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  61.44 
 
 
236 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  61.44 
 
 
236 aa  299  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  61.02 
 
 
236 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  58.9 
 
 
236 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  58.47 
 
 
288 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  55.32 
 
 
238 aa  258  5e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  37.24 
 
 
236 aa  161  8e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  40.17 
 
 
230 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 
229 aa  144  8e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  33.61 
 
 
234 aa  130  2e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
223 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  35.86 
 
 
229 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  35.02 
 
 
229 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  35.02 
 
 
229 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  35.02 
 
 
229 aa  120  1e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  35.02 
 
 
229 aa  120  1e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  35.02 
 
 
229 aa  120  1e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  35.02 
 
 
229 aa  120  1e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  35.02 
 
 
229 aa  120  1e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  33.2 
 
 
244 aa  119  4e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  33.9 
 
 
220 aa  118  8e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  34.06 
 
 
224 aa  114  9e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 
222 aa  114  1e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 
234 aa  111  1e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
224 aa  110  2e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
224 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  31.3 
 
 
235 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 
223 aa  108  9e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 
223 aa  108  9e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
250 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
236 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
227 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
224 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
236 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 
224 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 
224 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 
224 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 
222 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 
224 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 
224 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 
244 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.96 
 
 
224 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 
211 aa  98.6  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 
225 aa  98.6  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  29.54 
 
 
271 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
222 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  28.94 
 
 
224 aa  82.8  4e-15  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 
218 aa  80.9  2e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 
231 aa  74.3  2e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  26.2 
 
 
209 aa  61.2  1e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
203 aa  55.1  1e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
203 aa  55.1  1e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
203 aa  55.1  1e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  26.55 
 
 
203 aa  52  7e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  27.19 
 
 
220 aa  51.6  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  24.89 
 
 
202 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  23.89 
 
 
225 aa  45.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  26.64 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  22.69 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  22.36 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  34.41 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 
223 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1617  Phosphoglycerate mutase  24.68 
 
 
199 aa  41.6  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  34.44 
 
 
213 aa  41.6  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>