More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1232 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  100 
 
 		 431 aa  863    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  99.54 
 
 		 431 aa  861    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  56.83 
 
 		 417 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  54.24 
 
 		 420 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  54.52 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  52.39 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  52.42 
 
 		 435 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  54.21 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  54.21 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  53.83 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  52.29 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  52.29 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  53.68 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  51.09 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  52.05 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  50.99 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  50.61 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  57.01 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  50.85 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  51.95 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  52.46 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  53.9 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  51.21 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  50.12 
 
 		 436 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  52.05 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  52.05 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  52.05 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  52.05 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  52.22 
 
 		 409 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  51.23 
 
 		 912 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  54.77 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  53.43 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  50.49 
 
 		 895 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  52.38 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  48.59 
 
 		 905 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  52.5 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  48.93 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  48.3 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  49.01 
 
 		 409 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  50.35 
 
 		 893 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 460 aa  358  9e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  49.28 
 
 		 453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  47.54 
 
 		 917 aa  346  5e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 459 aa  338  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 421 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 422 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  44.52 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  44.63 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  43.2 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  48 
 
 		 413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  43.2 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  42.96 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  45.79 
 
 		 422 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 444 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 472 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 494 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  29.5 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  29.5 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  29.5 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  29.5 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  29.5 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  29.5 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  29.5 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  29.25 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  33.33 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  31.36 
 
 		 403 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3087  major facilitator superfamily transporter  30.53 
 
 		 419 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  30.79 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  31.84 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  30.14 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  33.16 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  31.13 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 403 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 398 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>