36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3783 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  645    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  51.8 
 
 		 310 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  51.15 
 
 		 332 aa  319  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  49.67 
 
 		 308 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  49.67 
 
 		 308 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  49.34 
 
 		 307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  48.51 
 
 		 319 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  48.18 
 
 		 331 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  48.68 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  48.68 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  48.38 
 
 		 319 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  48.68 
 
 		 307 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  42.76 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  37.88 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  37.88 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  37.88 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  37.88 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  36.15 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.6 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.27 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  25.2 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.2 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.95 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.83 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.03 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.65 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.9 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  24.63 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.04 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  26.97 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.38 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.56 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.51 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.28 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.1 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.04 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>