More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0077 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  100 
 
 		 154 aa  315  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07001  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 143 aa  290  7e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0209563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  72.73 
 
 		 150 aa  212  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  72.73 
 
 		 150 aa  211  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  72.03 
 
 		 150 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  70.63 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  69.12 
 
 		 186 aa  207  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  69.06 
 
 		 148 aa  206  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1775  ferric uptake regulator family protein  60.93 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.103697  normal  0.0302993 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0869  ferric uptake regulator family protein  59.73 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  41.73 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0564  ferric uptake regulator  43.8 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1958  ferric uptake regulator family protein  41.18 
 
 		 170 aa  123  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0491085  hitchhiker  0.00899541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  39.57 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  38.73 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3952  ferric uptake regulator, Fur family  39.58 
 
 		 177 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3404  ferric uptake regulator family protein  36.88 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.092554  normal  0.327657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0896  ferric uptake regulator, Fur family  38.19 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000149123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0870  ferric uptake regulator, Fur family  38.19 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  38.1 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  37.59 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  37.59 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  33.1 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  34.85 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  35.34 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  32.39 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 166 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  31.62 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0251  ferric uptake regulator, Fur family  35.22 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  33.83 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  39.26 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  35.97 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2170  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.414225 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  36.92 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  29.41 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  32.62 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  34.85 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  28.47 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  28.47 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  35.07 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  34.67 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  30.15 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  32.39 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  28.15 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  31.69 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  34.81 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  34.53 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  34.53 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  34.29 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  35.77 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0396  ferric uptake regulator, Fur family  28.78 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  32.62 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  36.92 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  32.85 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  34.29 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  36.03 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  29.55 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  31.16 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  28.79 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.08 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  29.55 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  28.15 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  30.5 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  29.55 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  29.55 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  29.55 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  29.55 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  32.03 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  28.91 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  28.91 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  28.91 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  34.03 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  31.11 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>