78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31723 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_31723  predicted protein  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490385  normal  0.555446 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 		 627 aa  83.2  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02830  nitrogen metabolism-related protein, putative  28.06 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0852649  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  26.69 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  25.96 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  26.55 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  26.01 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.5 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  24.34 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10110  hydantoin racemase (Dcg1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13380)  27.89 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.208544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.23 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.45 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  26.84 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  25.55 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  25.22 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  25.22 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  28.57 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  25.78 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  25.68 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  26.2 
 
 		 287 aa  62  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.06 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  25.65 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  25.65 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  29.49 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  25.65 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  25.65 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  25.65 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  25.65 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.98 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.85 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  26.24 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  26.38 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.11 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  27.59 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.57 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.63 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.79 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  23.63 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.02 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  25.11 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  27.63 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  28.45 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  28.45 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  28.14 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  28.14 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.63 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  26.22 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  23.93 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.51 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.62 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  23.93 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.36 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.32 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  23.48 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  24.22 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.68 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  23.5 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  24.37 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  25 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.08 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  25.66 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  26.79 
 
 		 258 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.01 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.1 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.26 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  24.66 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2068  Asp/Glu racemase  24.55 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  26.61 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  26.61 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  26.61 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  27.59 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  24.23 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  27.59 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  21.89 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  23.4 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  25.46 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.35 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.55 
 
 		 256 aa  41.6  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>