25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50155 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_50155  chitinase chitin binding glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 525 aa  1076    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.487357  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01990  hypothetical protein  24.27 
 
 		 582 aa  60.1  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  31.58 
 
 		 782 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  22.49 
 
 		 578 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  28.85 
 
 		 848 aa  55.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  29.11 
 
 		 782 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  24.55 
 
 		 471 aa  53.5  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  29.41 
 
 		 846 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  28.76 
 
 		 846 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  24.24 
 
 		 420 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  25.99 
 
 		 613 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  28.19 
 
 		 846 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46067  chitin binding  45.16 
 
 		 502 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  21.07 
 
 		 536 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  36.11 
 
 		 827 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  24.14 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  24.14 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00509  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13720)  23.81 
 
 		 1481 aa  47  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.658967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.99 
 
 		 648 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  28.32 
 
 		 516 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  25.36 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  22.97 
 
 		 353 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  27.34 
 
 		 467 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  26.98 
 
 		 460 aa  44.3  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>