44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40174 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  100 
 
 
897 aa  1842    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47188  predicted protein  30.42 
 
 
916 aa  323  8e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  29.47 
 
 
471 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  31.56 
 
 
464 aa  105  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  33.44 
 
 
620 aa  97.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  29.69 
 
 
770 aa  95.5  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  27.42 
 
 
466 aa  90.9  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  24.92 
 
 
815 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  29.25 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  23.49 
 
 
781 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  27.51 
 
 
614 aa  82.4  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  26.99 
 
 
692 aa  77  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  31.75 
 
 
522 aa  75.5  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  25.82 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  27.42 
 
 
661 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  24.9 
 
 
430 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2399  leucine rich repeat protein  28.33 
 
 
368 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  25.48 
 
 
432 aa  66.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  26.99 
 
 
591 aa  62.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  28.49 
 
 
400 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  25.67 
 
 
344 aa  62.4  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0025  cyclin domain-containing protein  31.11 
 
 
807 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  28.35 
 
 
241 aa  58.5  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0110  hypothetical protein  32.77 
 
 
254 aa  57.8  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02003  GALA protein  27.92 
 
 
518 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128117  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  29.73 
 
 
465 aa  55.8  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7574  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  29.17 
 
 
385 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  27.01 
 
 
647 aa  54.7  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  27.9 
 
 
981 aa  54.7  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33382  predicted protein  23.56 
 
 
462 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0729  hypothetical protein  27.42 
 
 
476 aa  54.3  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0725  hypothetical protein  27.57 
 
 
510 aa  53.5  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.426015 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  27.27 
 
 
295 aa  50.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03210  Ran GTPase activator, putative  23.1 
 
 
404 aa  48.9  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0318  hypothetical protein  26.85 
 
 
508 aa  48.5  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34431  predicted protein  26.46 
 
 
261 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362654  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29269  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  32.38 
 
 
656 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.159066  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41374  predicted protein  41.18 
 
 
262 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00887084  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50414  predicted protein  41.18 
 
 
262 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0185184  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1754  LRR-repeat protein  27.73 
 
 
167 aa  45.4  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.022386 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88061  predicted protein  36.59 
 
 
936 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0276819  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49435  predicted protein  38.46 
 
 
675 aa  44.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04862  Ran specific GTPase activating protein An-RanGAP (Eurofung)  25.24 
 
 
417 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.863304  normal  0.748765 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16663  predicted protein  29.65 
 
 
1048 aa  44.3  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>