16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37425 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  100 
 
 
1569 aa  2646    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  41.11 
 
 
1034 aa  295  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  41.06 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  36.42 
 
 
347 aa  114  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  41.29 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_1800  predicted protein  47.4 
 
 
284 aa  92  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3687  hypothetical protein  36.87 
 
 
473 aa  67.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7107  hypothetical protein  36.94 
 
 
829 aa  58.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15060  predicted protein  36.32 
 
 
191 aa  58.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  22.6 
 
 
495 aa  58.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  30.08 
 
 
429 aa  58.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  31.67 
 
 
245 aa  58.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  29.69 
 
 
421 aa  56.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  34.22 
 
 
952 aa  55.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  42.67 
 
 
1060 aa  54.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  37.65 
 
 
942 aa  52.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>