30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0113 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  98.24 
 
 		 397 aa  802    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 397 aa  815    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  69.57 
 
 		 397 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  68.96 
 
 		 395 aa  571  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  67.02 
 
 		 390 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  65.51 
 
 		 388 aa  520  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  54.4 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  54.4 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  51.39 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  50.8 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  49.59 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  43.24 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  42.2 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  40.93 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  40.38 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  38.63 
 
 		 397 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  38.26 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  24.7 
 
 		 1079 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  28.8 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  24.4 
 
 		 652 aa  56.2  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  25.7 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  26.85 
 
 		 522 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  26.36 
 
 		 623 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  27.85 
 
 		 472 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  24.01 
 
 		 504 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  23.73 
 
 		 581 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  27.85 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  26.32 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 		 850 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  32.48 
 
 		 639 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>