38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4869 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  100 
 
 
569 aa  1152    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  51.69 
 
 
592 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  51.69 
 
 
592 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  50.7 
 
 
557 aa  525  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  35.4 
 
 
605 aa  329  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  31.35 
 
 
558 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  27.87 
 
 
533 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  27.87 
 
 
533 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  28.82 
 
 
532 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  29.64 
 
 
547 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  28.78 
 
 
526 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  29.15 
 
 
528 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  28.7 
 
 
528 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  32.13 
 
 
546 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  31.28 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  26.59 
 
 
546 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  26.59 
 
 
546 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 
513 aa  70.1  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  31.67 
 
 
536 aa  63.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  29.92 
 
 
563 aa  58.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  30.29 
 
 
535 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  26.54 
 
 
543 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  35.66 
 
 
492 aa  57.4  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  29.07 
 
 
618 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  26.52 
 
 
531 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  29.14 
 
 
557 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  24.55 
 
 
531 aa  54.3  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  29.14 
 
 
557 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
510 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  29.86 
 
 
544 aa  48.5  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  23.83 
 
 
564 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  25 
 
 
658 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0697  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
543 aa  47.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.203692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  37.5 
 
 
727 aa  47  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  25.84 
 
 
618 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  32.65 
 
 
616 aa  47  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  30.99 
 
 
516 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  30.99 
 
 
516 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>