47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2246 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  60.43 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  57.64 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  60.87 
 
 		 147 aa  173  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  60.87 
 
 		 147 aa  173  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  52.82 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  29.93 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  32.17 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  30.07 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.2 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  31.47 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  27.86 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  32 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  32.17 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  30.61 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  29.8 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  27.12 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  32.19 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  30.13 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  30.13 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  27.4 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  26.28 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  30.56 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  31.51 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  28.47 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  31.94 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  31.94 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  30.67 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  30 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  29.53 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  28.86 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  29.55 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  24.84 
 
 		 165 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  25.56 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  23.94 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  31.58 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  24.49 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  28.28 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>