86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3490 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  454  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  91.28 
 
 		 218 aa  424  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  58.1 
 
 		 216 aa  271  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  55.24 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  53.59 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  52.58 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  52.2 
 
 		 242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  55.45 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  55.45 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  55.45 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  51.42 
 
 		 214 aa  224  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  52.15 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  49.76 
 
 		 214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  48.87 
 
 		 256 aa  217  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  51.46 
 
 		 222 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  51.64 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  46.01 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  45.93 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  45.45 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  48.06 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  47.57 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  45.15 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  46.83 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  47.57 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  46.63 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  37.32 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  32.86 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  32.82 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  40.94 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  31.22 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  41.84 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  41.84 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  41.84 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  41.84 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  41.84 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  41.84 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  41.84 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  31.77 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  28.49 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  31.25 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  29.44 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  31.77 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  31.77 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  30.73 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  29.06 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  32.9 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  31.05 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  28.72 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  27.12 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  28.36 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  27.92 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  27.92 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  29.93 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  27.42 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  28.8 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  29.47 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  27.23 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  29.35 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  28.72 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  27.86 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  26.4 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  27 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  26.77 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  22.27 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  25.27 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  27.46 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  26.53 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  26.06 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  26.06 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  30.08 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  25.53 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  27.03 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  26.32 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  25.24 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  22.28 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  25.71 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  25.17 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  24.42 
 
 		 336 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  22.8 
 
 		 297 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  28.11 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  24.74 
 
 		 297 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  22.65 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>