More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2434 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  100 
 
 		 564 aa  1174    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  71.12 
 
 		 559 aa  836    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  56.23 
 
 		 537 aa  570  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  33.33 
 
 		 520 aa  266  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1013  sulfatase  34.14 
 
 		 515 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  33.27 
 
 		 523 aa  253  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  33.27 
 
 		 522 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  33.94 
 
 		 511 aa  246  6.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  32.52 
 
 		 511 aa  246  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  32.52 
 
 		 526 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  35.46 
 
 		 506 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  31.64 
 
 		 483 aa  233  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  32.57 
 
 		 474 aa  231  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  32.62 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  31.65 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3110  sulfatase  31.87 
 
 		 492 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1130  sulfatase  30.25 
 
 		 537 aa  197  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2610  sulfatase  31.35 
 
 		 477 aa  196  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000218719  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  31.01 
 
 		 549 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1033  sulfatase  30.84 
 
 		 581 aa  189  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  29.69 
 
 		 453 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  27.96 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  29.51 
 
 		 517 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0054  sulfatase  29.55 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  28.69 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1248  sulfatase  29.77 
 
 		 501 aa  168  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  28.05 
 
 		 490 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2114  sulfatase  29.84 
 
 		 484 aa  166  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.711307  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  24.42 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  29.61 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  37.45 
 
 		 545 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  28.99 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  28.14 
 
 		 447 aa  164  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  30.32 
 
 		 481 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  28.08 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  28.01 
 
 		 459 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0627  sulfatase  29.42 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  28.72 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  27.39 
 
 		 481 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1890  sulfatase  27.57 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.461915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  26.86 
 
 		 535 aa  154  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  29.87 
 
 		 491 aa  153  8e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  29.39 
 
 		 500 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47845  predicted protein  27.75 
 
 		 620 aa  150  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0593792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3902  sulfatase  29.67 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  28.07 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4926  sulfatase  28.02 
 
 		 534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  27.23 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  27.52 
 
 		 520 aa  148  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  26.56 
 
 		 489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  27.47 
 
 		 498 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3441  sulfatase  27.13 
 
 		 511 aa  146  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2189  sulfatase  28.35 
 
 		 524 aa  146  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.2172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  28.06 
 
 		 553 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  26.99 
 
 		 487 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  27.87 
 
 		 517 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1074  sulfatase  35.32 
 
 		 552 aa  144  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0111181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  29.39 
 
 		 492 aa  144  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7372  N-acetylglucosamine-6-sulfatase  28.71 
 
 		 513 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.834841 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  26.09 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  27.05 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5375  sulfatase  34.26 
 
 		 560 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  27.02 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  28.87 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  25.96 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  26.71 
 
 		 495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  26.02 
 
 		 586 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  27.83 
 
 		 486 aa  140  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  26.91 
 
 		 482 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  27.75 
 
 		 480 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  26.31 
 
 		 497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  28.39 
 
 		 457 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  27.05 
 
 		 523 aa  136  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  25.91 
 
 		 549 aa  136  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  25.46 
 
 		 491 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  28.48 
 
 		 486 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  25.44 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  25.73 
 
 		 497 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  26 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  27.04 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  25.83 
 
 		 470 aa  134  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2825  sulfatase  28.72 
 
 		 464 aa  134  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424556  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  25.25 
 
 		 497 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11149  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 		 565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122121  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  25.05 
 
 		 497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  25.05 
 
 		 497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  29.15 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  25.05 
 
 		 497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  26.14 
 
 		 449 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08341  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02520)  26.25 
 
 		 608 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  27.56 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  26.44 
 
 		 562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  26.7 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  26.49 
 
 		 503 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  27.75 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  26.37 
 
 		 489 aa  130  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  26.4 
 
 		 474 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  25.88 
 
 		 518 aa  130  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  25.45 
 
 		 508 aa  130  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  27.68 
 
 		 553 aa  130  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>