28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0094 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0094  YhhN family protein  100 
 
 		 209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0089  YhhN family protein  93.78 
 
 		 209 aa  367  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3881  YhhN family protein  63.46 
 
 		 209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3946  hypothetical protein  63.46 
 
 		 208 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3777  hypothetical protein  63.46 
 
 		 208 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3767  hypothetical protein  63.46 
 
 		 208 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3887  hypothetical protein  63.46 
 
 		 208 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3844  hypothetical protein  63.46 
 
 		 208 aa  247  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3872  YhhN family protein  61.06 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  0.191907 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0247  YhhN family protein  61.54 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03270  hypothetical protein  61.54 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4788  hypothetical protein  61.54 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3854  hypothetical protein  61.54 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.85502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3751  hypothetical protein  61.54 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0248  YhhN family protein  61.54 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3950  hypothetical protein  61.54 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03317  conserved inner membrane protein  61.54 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3667  hypothetical protein  61.06 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0212  YhhN family protein  62.98 
 
 		 208 aa  214  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3984  YhhN family protein  66.83 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0572  hypothetical protein  66.83 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0234  hypothetical protein  66.83 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.674365  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002133  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00285  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  26.84 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2377  hypothetical protein  25 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  30.23 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  21.58 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>