293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3790 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  100 
 
 
388 aa  796    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  50 
 
 
883 aa  347  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  48.06 
 
 
600 aa  346  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  47.91 
 
 
628 aa  345  7e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  46.74 
 
 
584 aa  332  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  46.8 
 
 
1403 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  45.13 
 
 
1409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  46.04 
 
 
1401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  47.92 
 
 
1357 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  45.9 
 
 
1407 aa  323  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  45.43 
 
 
610 aa  322  8e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.52 
 
 
607 aa  322  8e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  48.03 
 
 
1341 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  47.23 
 
 
1405 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  46.84 
 
 
1397 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  46.58 
 
 
1397 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  46.61 
 
 
1338 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  45.83 
 
 
1257 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  46.44 
 
 
1395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  47.15 
 
 
659 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  46.04 
 
 
1405 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  44.85 
 
 
376 aa  311  1e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  46.39 
 
 
1400 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  44.91 
 
 
607 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  46.58 
 
 
1418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  46.32 
 
 
1427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  46.77 
 
 
539 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.81 
 
 
610 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  46.58 
 
 
1418 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  46.58 
 
 
1398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  46.58 
 
 
1418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  46.58 
 
 
1418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  46.58 
 
 
1418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  46.58 
 
 
1418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  45.26 
 
 
605 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.15 
 
 
613 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  44.39 
 
 
609 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  45.41 
 
 
1396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  45.69 
 
 
540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  45.65 
 
 
1395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  45.65 
 
 
1395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  45.65 
 
 
1395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  45.22 
 
 
539 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2298  sulfite reductase  44.36 
 
 
534 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253537  normal  0.965047 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  41.97 
 
 
623 aa  301  9e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  44.73 
 
 
600 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  44.73 
 
 
612 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  43.6 
 
 
609 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  43.6 
 
 
599 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  41.97 
 
 
613 aa  300  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  43.98 
 
 
599 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2866  sulfite reductase  45.26 
 
 
537 aa  299  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890512  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  42.67 
 
 
614 aa  299  6e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  44.56 
 
 
600 aa  299  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  43.46 
 
 
599 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  43.41 
 
 
602 aa  296  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  43.46 
 
 
599 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  42.23 
 
 
554 aa  296  4e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  43.19 
 
 
599 aa  296  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  43.19 
 
 
599 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  43.19 
 
 
599 aa  296  6e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  43.19 
 
 
599 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.04 
 
 
1383 aa  295  9e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  43.08 
 
 
599 aa  295  9e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  43.19 
 
 
599 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  43.19 
 
 
599 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  43.19 
 
 
599 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.93 
 
 
599 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  43.04 
 
 
535 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  41.79 
 
 
613 aa  292  7e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  42.93 
 
 
599 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  41.84 
 
 
600 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.04 
 
 
588 aa  290  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  43.04 
 
 
588 aa  290  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  42.67 
 
 
599 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4954  sulfite reductase  42.52 
 
 
534 aa  288  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4491  sulfite reductase  42.52 
 
 
534 aa  288  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  41.6 
 
 
631 aa  288  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  41.88 
 
 
601 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  45.84 
 
 
1370 aa  285  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  40.05 
 
 
595 aa  285  1.0000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  43.6 
 
 
1384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.48 
 
 
604 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  39.28 
 
 
612 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  41.09 
 
 
599 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.58 
 
 
604 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  46.48 
 
 
1394 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.67 
 
 
599 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.83 
 
 
599 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.22 
 
 
604 aa  280  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  41.34 
 
 
599 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  37.53 
 
 
614 aa  279  5e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.57 
 
 
599 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  41.25 
 
 
608 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.58 
 
 
599 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.41 
 
 
608 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.23 
 
 
598 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  40.93 
 
 
607 aa  276  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.62 
 
 
595 aa  275  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4136  sulfite reductase  43.27 
 
 
535 aa  275  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>