More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2848 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
162 aa  315  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  37.42 
 
 
181 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  41.06 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  36.94 
 
 
168 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  38.85 
 
 
171 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
164 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  37.18 
 
 
173 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  37.18 
 
 
173 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  34.59 
 
 
164 aa  99  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 
175 aa  95.5  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
175 aa  94.4  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  30.13 
 
 
199 aa  92.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  34.62 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
167 aa  92.8  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  32.89 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  28.85 
 
 
206 aa  91.3  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  34.21 
 
 
168 aa  90.5  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  34.23 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  32.48 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  31.21 
 
 
194 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  32.45 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
175 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  32.45 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  35.22 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  30.19 
 
 
175 aa  89  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  31.85 
 
 
179 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  31.85 
 
 
179 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.49 
 
 
203 aa  88.2  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  33.1 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  33.09 
 
 
146 aa  88.6  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
161 aa  87.4  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 
165 aa  87.4  8e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  29.56 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  33.55 
 
 
174 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  32.7 
 
 
175 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  32.9 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  33.57 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  32.9 
 
 
168 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  32.9 
 
 
168 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  32.9 
 
 
168 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  32.9 
 
 
168 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  32.26 
 
 
178 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  32.9 
 
 
168 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  32.9 
 
 
168 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  32.24 
 
 
168 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  32.24 
 
 
168 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  31.37 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  28.85 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  33.55 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  32.17 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  33.55 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  31.47 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  32.24 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  31.61 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  31.47 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  29.11 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  28.48 
 
 
264 aa  80.5  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  31.76 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  32.26 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  29.22 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  31.61 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  27.63 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>