More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1696 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  284  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  60.56 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  59.86 
 
 
142 aa  159  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  56.34 
 
 
143 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  53.15 
 
 
142 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  53.85 
 
 
143 aa  136  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  53.85 
 
 
142 aa  130  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  51.06 
 
 
143 aa  130  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  51.39 
 
 
142 aa  123  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  45.32 
 
 
143 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  43.26 
 
 
144 aa  114  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  40.85 
 
 
144 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  39.72 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  40.14 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  38.73 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  40.14 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  50.69 
 
 
142 aa  110  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  40.43 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  42.55 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  43.97 
 
 
143 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  42.14 
 
 
144 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  45.11 
 
 
143 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  45.11 
 
 
143 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  43.26 
 
 
142 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  42.55 
 
 
147 aa  105  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  43.26 
 
 
143 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  44.68 
 
 
177 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  43.51 
 
 
142 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  44.44 
 
 
144 aa  104  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  41.41 
 
 
144 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  41.84 
 
 
147 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  42.45 
 
 
144 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  44.68 
 
 
143 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 
143 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  41.13 
 
 
142 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  41.13 
 
 
141 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  42.19 
 
 
144 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  41.73 
 
 
144 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 
145 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  45.26 
 
 
143 aa  100  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  40.97 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  39.55 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  41.84 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  40.97 
 
 
153 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  40.97 
 
 
153 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  40.97 
 
 
153 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  40.71 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  39.57 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  43.07 
 
 
145 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  39.58 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  40 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  40.97 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  38.3 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  39.58 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.03 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  38.03 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  39.01 
 
 
143 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  44.12 
 
 
145 aa  93.6  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  42.4 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  44.12 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  37.59 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  38.85 
 
 
174 aa  92  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3505  signal-transduction protein  48.23 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3517  signal-transduction protein  48.23 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3577  signal-transduction protein  48.23 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  40.29 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  38.19 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  40 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
154 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
154 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
154 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  36.88 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
154 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
154 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
154 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
154 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  42.31 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  36.17 
 
 
165 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  38.73 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1379  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 
151 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.925152  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4603  XRE family transcriptional regulator  35.46 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545277  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  39.72 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0976  XRE family transcriptional regulator  35.46 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  40.54 
 
 
143 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1339  XRE family transcriptional regulator  35.46 
 
 
151 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1458  XRE family transcriptional regulator  35.46 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.867241  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1436  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  36.43 
 
 
164 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  38.03 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1791  XRE family transcriptional regulator  35.46 
 
 
151 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0944  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1864  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0408714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1687  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  35.25 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1710  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0404  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>