70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0816 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  100 
 
 
229 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  59.47 
 
 
222 aa  228  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  51.53 
 
 
229 aa  201  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  51.57 
 
 
232 aa  191  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  48.87 
 
 
226 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  46.43 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  46.15 
 
 
223 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  46.19 
 
 
225 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  45.81 
 
 
231 aa  161  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  42.6 
 
 
232 aa  157  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  43.23 
 
 
222 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  45.05 
 
 
221 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  43.96 
 
 
227 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  42.15 
 
 
232 aa  138  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  37.95 
 
 
223 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  42.16 
 
 
243 aa  135  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  36.77 
 
 
223 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  36.32 
 
 
223 aa  134  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  35.43 
 
 
222 aa  126  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  38.39 
 
 
223 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  40 
 
 
222 aa  121  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  38.43 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  41.53 
 
 
244 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  36.56 
 
 
225 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  35.71 
 
 
226 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  35.84 
 
 
226 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  33.18 
 
 
225 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  31.63 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  33.02 
 
 
220 aa  95.9  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  35.35 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  37.83 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  36.53 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.36 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  40.09 
 
 
222 aa  89  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.43 
 
 
222 aa  89  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  34.42 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  31.94 
 
 
200 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  30.63 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.96 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.72 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  27.39 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  34.38 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.49 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37.44 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  36.36 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.07 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.63 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.92 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.71 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.7 
 
 
205 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.51 
 
 
209 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.14 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  33.17 
 
 
208 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.2 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  41.01 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.58 
 
 
316 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.86 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.22 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.02 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  31.63 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  31.32 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  27.55 
 
 
188 aa  48.5  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  25.64 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  35.11 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.17 
 
 
223 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  22.79 
 
 
219 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.35 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.58 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.46 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>