120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0094 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  100 
 
 
239 aa  468  1e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.92 
 
 
245 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  36.86 
 
 
234 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2076  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.48 
 
 
245 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.491688 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.61 
 
 
247 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  35.83 
 
 
243 aa  132  4e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  35.02 
 
 
288 aa  132  7e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  35.44 
 
 
238 aa  130  2e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.29 
 
 
244 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  38.01 
 
 
280 aa  128  7e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  38.01 
 
 
280 aa  128  7e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  38.01 
 
 
318 aa  128  7e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  38.01 
 
 
280 aa  128  7e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  38.01 
 
 
327 aa  128  7e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  38.01 
 
 
280 aa  128  7e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  37.56 
 
 
287 aa  128  9e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.86 
 
 
278 aa  127  1e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  35.86 
 
 
279 aa  127  1e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.44 
 
 
253 aa  127  1e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  35.86 
 
 
263 aa  127  2e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  35.86 
 
 
263 aa  127  2e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  35.44 
 
 
263 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.18 
 
 
288 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.2 
 
 
278 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2261  racemase, putative  31.88 
 
 
238 aa  125  8e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.9 
 
 
245 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.44 
 
 
263 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  35.04 
 
 
243 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.39 
 
 
285 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  34.62 
 
 
243 aa  121  1e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.86 
 
 
245 aa  120  2e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  31.28 
 
 
243 aa  119  4e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.22 
 
 
244 aa  119  5e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  41.53 
 
 
205 aa  118  8e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  33.33 
 
 
232 aa  116  2e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.44 
 
 
247 aa  117  2e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.92 
 
 
245 aa  117  2e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  35.02 
 
 
261 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  33.33 
 
 
243 aa  115  4e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  33.33 
 
 
247 aa  115  9e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  33.04 
 
 
247 aa  113  2e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  38.02 
 
 
241 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  34.52 
 
 
258 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  33.04 
 
 
236 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.03 
 
 
247 aa  110  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  29.41 
 
 
243 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.73 
 
 
247 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  32.35 
 
 
242 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.65 
 
 
242 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.22 
 
 
242 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2139  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.38 
 
 
239 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0396546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  31.65 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  33.06 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.91 
 
 
240 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  31.65 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  32.91 
 
 
240 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  32.91 
 
 
240 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.4 
 
 
250 aa  98.6  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  31.65 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  32.91 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  32.29 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  29.71 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  30.93 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.08 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.43 
 
 
240 aa  92.4  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  30.96 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.25 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.81 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  29.96 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  29.83 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.1 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.56 
 
 
245 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.56 
 
 
245 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  33.84 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  27.41 
 
 
279 aa  83.6  2e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  29.65 
 
 
220 aa  84.3  2e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  29.65 
 
 
220 aa  84.3  2e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  29.65 
 
 
220 aa  84.3  2e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  30.8 
 
 
258 aa  83.6  3e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1959  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  82.8  4e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1965  hypothetical protein  25.34 
 
 
245 aa  82.4  6e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.1 
 
 
248 aa  79.7  3e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6268  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.03 
 
 
262 aa  79.3  4e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  26.05 
 
 
259 aa  77  2e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.95 
 
 
250 aa  75.9  5e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3417  Asp/Glu racemase  30.41 
 
 
252 aa  75.9  6e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0971  Asp/Glu racemase  28.23 
 
 
246 aa  75.1  9e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0912948  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  29.19 
 
 
250 aa  74.7  1e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  29.69 
 
 
212 aa  75.1  1e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2031  putative hydantoin racemase  28.04 
 
 
252 aa  73.6  3e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  30.62 
 
 
252 aa  69.3  5e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 
627 aa  67.8  1e-10  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1413  Hydantoin racemase-like protein  28.64 
 
 
262 aa  67.8  1e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  29.33 
 
 
227 aa  67.4  2e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  34.18 
 
 
229 aa  65.1  1e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.95 
 
 
226 aa  61.6  1e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  34.48 
 
 
205 aa  60.5  2e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  32.12 
 
 
218 aa  59.7  4e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4489  hypothetical protein  33.87 
 
 
262 aa  58.5  8e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4026  hydantoin racemase  23.85 
 
 
266 aa  56.2  4e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.997842 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>