More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2931 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2931  transposase  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  86.61 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  86.61 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  86.61 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  86.61 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  86.61 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  86.61 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  86.61 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  86.61 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  86.61 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  86.61 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  86.61 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  86.61 
 
 		 132 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  86.61 
 
 		 124 aa  204  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  86.61 
 
 		 124 aa  204  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  81.25 
 
 		 124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  79.46 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0214  transposase  90.43 
 
 		 106 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  51.68 
 
 		 253 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  51.68 
 
 		 253 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  51.68 
 
 		 253 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  51.68 
 
 		 253 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  48.39 
 
 		 255 aa  150  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  49.66 
 
 		 253 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  48.39 
 
 		 260 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  48.39 
 
 		 260 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  48.39 
 
 		 260 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  48.39 
 
 		 260 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  55.66 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  46.79 
 
 		 260 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  46.1 
 
 		 260 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  46.1 
 
 		 260 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  46.1 
 
 		 273 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  42.28 
 
 		 266 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  43.67 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  40.26 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  50.91 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  116  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01472  ISSod6, transposase  37.24 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01489  ISSod6, transposase  37.24 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  44.74 
 
 		 254 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  44.74 
 
 		 254 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  44.74 
 
 		 254 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  44.74 
 
 		 254 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  44.74 
 
 		 254 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  44.74 
 
 		 254 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  44.74 
 
 		 254 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  44.74 
 
 		 254 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  44.74 
 
 		 254 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  44.74 
 
 		 254 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  44.74 
 
 		 254 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  50.49 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  50.49 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  50.49 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  46.15 
 
 		 251 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  46.15 
 
 		 251 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  50.49 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  50.49 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  50.49 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  39.6 
 
 		 249 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  39.19 
 
 		 249 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.13 
 
 		 251 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  40.48 
 
 		 304 aa  110  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.74 
 
 		 281 aa  110  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  38.89 
 
 		 251 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  43.08 
 
 		 235 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  43.24 
 
 		 252 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  43.24 
 
 		 252 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.19 
 
 		 252 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.19 
 
 		 252 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  42.73 
 
 		 115 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  45.05 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  45.05 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  45.05 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  45.05 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  45.05 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  37.31 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  43.64 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  43.64 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  49.52 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  43.33 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.36 
 
 		 281 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  43.64 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  43.64 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.75 
 
 		 281 aa  104  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  46.15 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  46.15 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  46.15 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  34.9 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  34.9 
 
 		 252 aa  102  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  34.9 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  34.9 
 
 		 252 aa  102  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  34.9 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  34.9 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  34.9 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  34.9 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  34.9 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  33.56 
 
 		 253 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  33.56 
 
 		 253 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  33.56 
 
 		 254 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>