51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4126 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  100 
 
 		 132 aa  269  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  55.21 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  47.11 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  46.09 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  45.28 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  47.11 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  42.28 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  46.39 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  41.44 
 
 		 115 aa  96.7  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  46.15 
 
 		 110 aa  96.7  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  45.36 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  49.48 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  45.1 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  45.36 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  39.34 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  45.1 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  53.49 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  38.39 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  45.26 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  48.94 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  39.81 
 
 		 122 aa  84.3  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  48.45 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  36.76 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  39.18 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  40 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  39.62 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  39.22 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  45.13 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  41.38 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  31.46 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  32.58 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  29 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  26.53 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  26.53 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  30.68 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  27.66 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  30.68 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  29.55 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  27.66 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  28.26 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  28.42 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  27.37 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  28.09 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  27.37 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  27.91 
 
 		 103 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  29.9 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  26.5 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  26.67 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  27.17 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>