More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2276 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2276  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
284 aa  567  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295611  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1757  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  69.85 
 
 
263 aa  345  7e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1800  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.17 
 
 
280 aa  285  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.92 
 
 
265 aa  265  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.0753834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2929  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.28 
 
 
251 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000223394  hitchhiker  9.00382e-06 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2374  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.66 
 
 
268 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00970599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2709  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.42 
 
 
258 aa  235  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0834008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2341  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.61 
 
 
255 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0083656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19720  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.3 
 
 
260 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.05 
 
 
256 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2904  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.98 
 
 
258 aa  214  1e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  6.0141e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3412  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.08 
 
 
258 aa  212  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1894  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.53 
 
 
266 aa  208  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637186  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0112  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.57 
 
 
260 aa  205  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0230  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.66 
 
 
276 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2427  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.31 
 
 
294 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0521507  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2671  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.26 
 
 
274 aa  201  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1697  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.08 
 
 
276 aa  200  2e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5315  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.01 
 
 
264 aa  196  4e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565842  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2973  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.86 
 
 
268 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15710  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.12 
 
 
326 aa  174  2e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.813483  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01040  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.22 
 
 
279 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10322  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase glpQ2  41.18 
 
 
256 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.994523  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2653  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.84 
 
 
257 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15940  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.05 
 
 
282 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1033  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.56 
 
 
279 aa  120  4e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4097  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.69 
 
 
276 aa  117  2e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1999  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.48 
 
 
276 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.47 
 
 
289 aa  114  1e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0614299  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.33 
 
 
276 aa  114  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3985  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.97 
 
 
276 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5255  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.71 
 
 
263 aa  109  4e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6618  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.67 
 
 
297 aa  109  4e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0357026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0662  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.46 
 
 
304 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0956645  normal  0.017312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1855  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.29 
 
 
271 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.49147e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0435  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.27 
 
 
263 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2152  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.3 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3590  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.3 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.24 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  9.95679e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1604  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.74 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3861  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.74 
 
 
240 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2170  putative phosphodiesterase  30.74 
 
 
240 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25400  putative phosphodiesterase  30.3 
 
 
240 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14680  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31 
 
 
240 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.85 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.51 
 
 
233 aa  87.4  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1902  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.44 
 
 
240 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128239 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2131  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.08 
 
 
238 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2107  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  31 
 
 
240 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.14 
 
 
594 aa  85.5  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.1 
 
 
237 aa  85.1  1e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.24371e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.66 
 
 
245 aa  84.3  2e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1693  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.97 
 
 
238 aa  84  2e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1669  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.53 
 
 
238 aa  83.2  5e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.97 
 
 
227 aa  82.8  6e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1556  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.64 
 
 
252 aa  81.3  2e-14  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.449273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.16 
 
 
231 aa  80.9  2e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000197487 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  25.99 
 
 
224 aa  81.3  2e-14  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5469  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.3 
 
 
254 aa  81.3  2e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02000  glycerophosphodiester phosphodiesterase, putative  28.77 
 
 
349 aa  80.9  2e-14  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04965  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.05 
 
 
225 aa  80.5  3e-14  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.75 
 
 
257 aa  79.7  5e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0586  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.51 
 
 
240 aa  79  8e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0869814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30810  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.61 
 
 
246 aa  78.6  1e-13  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.53 
 
 
607 aa  78.6  1e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1216  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.62 
 
 
237 aa  77.4  2e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1053  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.65 
 
 
238 aa  77.8  2e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0259834 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0090  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.53 
 
 
607 aa  77.8  2e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.33 
 
 
291 aa  77.4  3e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.47655e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0095  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.53 
 
 
607 aa  77  3e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0091  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.53 
 
 
607 aa  76.6  4e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.02 
 
 
341 aa  76.6  5e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1116  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.05 
 
 
337 aa  76.3  5e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1460  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.44 
 
 
229 aa  76.3  5e-13  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0027  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.53 
 
 
247 aa  76.3  6e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1180  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.83 
 
 
308 aa  76.3  6e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.583587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2523  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase UgpQ, putative  26.53 
 
 
247 aa  76.3  6e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0212323  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0027  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.53 
 
 
247 aa  76.3  6e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1202  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.83 
 
 
308 aa  76.3  6e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0667881  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  24.23 
 
 
248 aa  75.1  1e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000464019  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0913  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.32 
 
 
236 aa  75.1  1e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1464  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.3 
 
 
327 aa  75.1  1e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3673  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.2 
 
 
330 aa  74.7  2e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.14 
 
 
241 aa  74.3  2e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1000  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.94 
 
 
242 aa  74.7  2e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0943134  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.14 
 
 
241 aa  74.3  2e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.28 
 
 
240 aa  74.3  2e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3655  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.96 
 
 
253 aa  74.3  2e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4195  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.86 
 
 
433 aa  73.9  3e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  27.04 
 
 
241 aa  73.6  3e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4183  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.53 
 
 
235 aa  73.9  3e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  26.67 
 
 
241 aa  73.9  3e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.04 
 
 
241 aa  73.9  3e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  26.39 
 
 
241 aa  73.6  3e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1364  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.23 
 
 
242 aa  73.6  4e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  6.43821e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.28 
 
 
242 aa  73.6  4e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.9 
 
 
241 aa  72.8  5e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7586  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.75 
 
 
335 aa  73.2  5e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3752  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.5 
 
 
238 aa  73.2  5e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00938184  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3189  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.63 
 
 
233 aa  72.8  7e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.772379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>