More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3861 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3861  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
460 aa  895    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00340007  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  59.18 
 
 
469 aa  485  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  63.23 
 
 
478 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  61.1 
 
 
459 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  55.02 
 
 
496 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  59.33 
 
 
464 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  58.48 
 
 
451 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  56.85 
 
 
458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  56.85 
 
 
458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  56.47 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  56.85 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  58.11 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3115  hypothetical protein  53.9 
 
 
456 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  55.85 
 
 
450 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  54.24 
 
 
462 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  52.32 
 
 
460 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  45.11 
 
 
452 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  46.84 
 
 
452 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  47.09 
 
 
520 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  43.06 
 
 
451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  41.39 
 
 
441 aa  285  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  47.84 
 
 
486 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  42.39 
 
 
451 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  43.08 
 
 
468 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
455 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  38.2 
 
 
452 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  37.47 
 
 
470 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  37.47 
 
 
471 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  37.47 
 
 
471 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  35.63 
 
 
451 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  37.41 
 
 
444 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 
438 aa  224  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  35.38 
 
 
574 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  35.12 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  36.06 
 
 
450 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  38 
 
 
486 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  37.16 
 
 
474 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  38.46 
 
 
451 aa  217  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  36.6 
 
 
503 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  34.17 
 
 
460 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  38.46 
 
 
451 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  31.57 
 
 
446 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  38.38 
 
 
443 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  34.87 
 
 
461 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  34.43 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  38.19 
 
 
445 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  31.84 
 
 
446 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  31.72 
 
 
490 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  38.56 
 
 
450 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  32.75 
 
 
430 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  31.63 
 
 
437 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  27.99 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  38.6 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  34.39 
 
 
443 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  30.14 
 
 
446 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  28.25 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  32.52 
 
 
431 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  32.83 
 
 
433 aa  177  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  32.4 
 
 
464 aa  177  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  26.79 
 
 
435 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  27.66 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  27.66 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  27.66 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  27.66 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  30.22 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  26.79 
 
 
435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  27.41 
 
 
435 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  27.41 
 
 
435 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  34.33 
 
 
452 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  29.6 
 
 
451 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  28.61 
 
 
435 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  31.36 
 
 
441 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  28.47 
 
 
446 aa  169  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  30.51 
 
 
438 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  28.92 
 
 
443 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  35.19 
 
 
439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  26.91 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  34.2 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  28.4 
 
 
445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  35.93 
 
 
470 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  29.62 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  27.57 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  27.57 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  27.57 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.26 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  25.71 
 
 
440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  32.78 
 
 
555 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  29.11 
 
 
432 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  29.18 
 
 
433 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  29.37 
 
 
432 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.86 
 
 
432 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  29.11 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  29.11 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  27.57 
 
 
451 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  27.74 
 
 
443 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  33.56 
 
 
453 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.97 
 
 
425 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  33.41 
 
 
453 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  34.11 
 
 
353 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>