267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1846 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1846  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
208 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0747958  normal  0.1639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1788  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.95 
 
 
208 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1236  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.28 
 
 
210 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5675  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.04 
 
 
210 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6039  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41.04 
 
 
210 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126863 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.04 
 
 
210 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152148 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7470  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  40.09 
 
 
210 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.43 
 
 
209 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41.44 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5382  acyl carrier protein phosphodiesterase, putative  37.44 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2250  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.69 
 
 
210 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488549  normal  0.224551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0754  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.89 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665769  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4802  putative (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase (ACP phosphodiesterase)  37.25 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4826  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.63 
 
 
210 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.37 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0927  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.55 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  34.58 
 
 
211 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  34.11 
 
 
211 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  33.64 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  34.11 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  33.64 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  34.11 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  33.64 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  33.64 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5107  azoreductase  29.83 
 
 
208 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0384145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  33.18 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  33.18 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.84 
 
 
207 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  31.78 
 
 
211 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5534  azoreductase  28.57 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5539  azoreductase  28.57 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  29.21 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  29.21 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5418  azoreductase  28.57 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  29.21 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  29.21 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  29.21 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  33.55 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  28.65 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1442  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.32 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.9 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.945859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0793  flavodoxin family protein  30.56 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  28.98 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  32.43 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0777  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.22 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  28.98 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0988  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.4 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3438  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.56 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.94 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.96 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  32.81 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  29.55 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.8 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.8 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.8 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.53 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.96 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3430  azoreductase  29.58 
 
 
230 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000541097  hitchhiker  0.0000000234591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1271  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.37 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1914  azoreductase  29.58 
 
 
230 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000230252  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  28.41 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3728  putative acyl carrier protein phosphodiesterase  31.07 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.32 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.32 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  27.84 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  27.32 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.89 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  27.32 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  27.32 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.32 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  27.32 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.89 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  29.58 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1770  azoreductase  29.58 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000243182  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3076  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.68 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1908  azoreductase  29.58 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351554  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.42 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1750  azoreductase  29.58 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24715e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1728  azoreductase  29.58 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  27.78 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.35 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1772  azoreductase  26.92 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000156707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1944  azoreductase  29.58 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4960600000000002e-30 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.79 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.19 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.51 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.23 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.6 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.57 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1478  azoreductase  28.87 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  27.37 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.37 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.88 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.28 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.88 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.44 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  27.17 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>