More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0988 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0988  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0793  flavodoxin family protein  70.2 
 
 		 198 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0777  acyl carrier protein phosphodiesterase  69.7 
 
 		 198 aa  291  6e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0927  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.21 
 
 		 201 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  44.75 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  44.75 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1271  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.05 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  39.07 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  39.07 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  39.07 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  39.07 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.945859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  38.5 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  39.07 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5107  azoreductase  38.46 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0384145  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  39.07 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  41.08 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  37.5 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  37.5 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  37.5 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  37.5 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  37.5 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  38.6 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  38.6 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  38.14 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  38.03 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5539  azoreductase  37.02 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  37.02 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5534  azoreductase  36.54 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5418  azoreductase  37.02 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1442  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 		 210 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  35.78 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  36.97 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3430  azoreductase  36.49 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000541097  hitchhiker  0.0000000234591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1914  azoreductase  36.49 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000230252  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1750  azoreductase  36.49 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24715e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1728  azoreductase  36.49 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1770  azoreductase  36.49 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000243182  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1908  azoreductase  36.49 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1944  azoreductase  36.02 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4960600000000002e-30 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3584  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 197 aa  121  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000358393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  35.05 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  34.02 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1478  azoreductase  36.97 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1772  azoreductase  35.55 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000156707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  36.92 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.2 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.2 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  36.22 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  34.5 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.68 
 
 		 199 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  35.44 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.44 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  35.44 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  35.44 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  36.46 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  36.46 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  36.46 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  36.46 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  35.44 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.71 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  36.46 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  35.44 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.2 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  35.2 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  34.74 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0427  Acyl carrier protein phosphodiesterase  40.11 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.319944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  33.84 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.34 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.51 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.55 
 
 		 209 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  34.27 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  34.27 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  34.27 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.22 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.89 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.99 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.89 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.11 
 
 		 198 aa  104  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.11 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.11 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.11 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.84 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.69 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.95 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.89 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.89 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.58 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  33.89 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  33.89 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.07 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.07 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.07 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.07 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.07 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.07 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.07 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.32 
 
 		 232 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0881  Acyl carrier protein phosphodiesterase  43.9 
 
 		 161 aa  99.4  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>