152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4563 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  233  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  90.52 
 
 		 138 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  68.32 
 
 		 105 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  68.32 
 
 		 105 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  69.31 
 
 		 105 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  65 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  66.99 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  55.86 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  56.19 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  56.14 
 
 		 114 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  60.19 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  61.86 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  58.76 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  54.29 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  50.93 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  63.16 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  53.54 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  56.86 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  52.38 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  59.79 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  56.25 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  54.95 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  55.79 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  56.52 
 
 		 115 aa  110  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  55.88 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  51.49 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  55.67 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  45.13 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  45 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  47.42 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  40.22 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  40.22 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  40.22 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  36.96 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  38.37 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  38.37 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  38.37 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  39.56 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  36.05 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000829166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  36.67 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  35.42 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  34.88 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  35.42 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  35.42 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  35.42 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  39.33 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  34 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  34.65 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3836  hypothetical protein  32.61 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3948  hypothetical protein  32.61 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.913691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3922  hypothetical protein  32.61 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  36 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  36 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  36.36 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  41.3 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  37.21 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  35.16 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  35.56 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  33.66 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  30.1 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4669  hypothetical protein  30.1 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  30.1 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  30.1 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  30.1 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  32.98 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0448  protein of unknown function DUF485  34.94 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0149641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0464  protein of unknown function DUF485  34.94 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2432  hypothetical protein  34.78 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.30839  normal  0.492052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  32.97 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  32.97 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1117  hypothetical protein  30.85 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.130739  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4212  hypothetical protein  32.61 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  31.87 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  28.83 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0959  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  36.96 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  35.37 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5956  hypothetical protein  37.35 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1455  hypothetical protein  25 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  32.97 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  32.67 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  30.86 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1981  hypothetical protein  33.73 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  37.36 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  33.33 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  31.31 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0555  protein of unknown function DUF485  38.1 
 
 		 102 aa  48.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.365765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  29.79 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  29.59 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  30 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  32.99 
 
 		 666 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  30.77 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3878  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280009  normal  0.825542 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>