More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4127 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
418 aa  808    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  82.49 
 
 
447 aa  630  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  75.36 
 
 
437 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  75.6 
 
 
426 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  75.6 
 
 
426 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  58.37 
 
 
423 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  48.41 
 
 
442 aa  368  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  46.25 
 
 
448 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  54.59 
 
 
441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  49.26 
 
 
442 aa  346  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  48.25 
 
 
398 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  51.26 
 
 
443 aa  338  9e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 
446 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  47.32 
 
 
423 aa  325  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  43.31 
 
 
438 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  47.31 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  47.81 
 
 
460 aa  302  6.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 
447 aa  300  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  40.54 
 
 
446 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 
430 aa  253  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 
439 aa  232  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 
486 aa  227  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  34.08 
 
 
430 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 
411 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  29.35 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.69 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  27.94 
 
 
430 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  27.94 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 
437 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  28.94 
 
 
434 aa  106  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
441 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
421 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  27.91 
 
 
428 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  28.3 
 
 
432 aa  96.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  25.07 
 
 
432 aa  94.4  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
415 aa  94  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  22.25 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  21.98 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  26.32 
 
 
434 aa  90.5  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  21.25 
 
 
434 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  25.47 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  29.41 
 
 
446 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  25 
 
 
428 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  24.29 
 
 
443 aa  88.2  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  29.41 
 
 
446 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  21.66 
 
 
434 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  24.29 
 
 
443 aa  87.4  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  22.63 
 
 
417 aa  87  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  27.76 
 
 
418 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  21.38 
 
 
421 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24.28 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  28.88 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  23.73 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  28.88 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  24.73 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  25.8 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  24.16 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  22.95 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  26.97 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  26.97 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  24.32 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  24.61 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  27.41 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  28.89 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  27.41 
 
 
366 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  24.27 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  26.37 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  27.8 
 
 
384 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  23.84 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  26.69 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  27.43 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  27.91 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  26.07 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  27.91 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  24.82 
 
 
453 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  27 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
431 aa  72.8  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  23.26 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  29.01 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  23.28 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  26.07 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  24.25 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  26.17 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  26.8 
 
 
405 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  25.7 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  25.79 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  24.68 
 
 
458 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  24.52 
 
 
450 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.89 
 
 
439 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  23.54 
 
 
438 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  22.61 
 
 
454 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  23.05 
 
 
406 aa  63.9  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>