263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2081 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  100 
 
 
380 aa  752    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  80.16 
 
 
405 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  65.9 
 
 
353 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  65.9 
 
 
353 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  65.9 
 
 
353 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13060  Fe(III)-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein fecB  62.89 
 
 
359 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0425065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  34.9 
 
 
309 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  32.55 
 
 
310 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  28.47 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  32.88 
 
 
346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3282  periplasmic binding protein  32.34 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  31.5 
 
 
319 aa  126  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  27.84 
 
 
324 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  31.14 
 
 
662 aa  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  32.99 
 
 
300 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  27.9 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.01 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.01 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  27.65 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.64 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  27.01 
 
 
321 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.01 
 
 
321 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.64 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  26.64 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  26.69 
 
 
320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  32.23 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.64 
 
 
321 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  26.11 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.64 
 
 
321 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  25.24 
 
 
320 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.64 
 
 
321 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  25.8 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  25.8 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  25.8 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  27.3 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  26.24 
 
 
305 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  24.52 
 
 
320 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.37 
 
 
326 aa  102  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  28.21 
 
 
306 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  34.29 
 
 
329 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  27.6 
 
 
331 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2943  periplasmic binding protein  28.88 
 
 
305 aa  93.6  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.382264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  28.72 
 
 
336 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  27.18 
 
 
316 aa  90.1  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  33.45 
 
 
309 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  29.62 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  26.78 
 
 
313 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  26.95 
 
 
329 aa  86.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  24.65 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  24.65 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  26.64 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.93 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  29.59 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  27.11 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  25.56 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  26.42 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  26.71 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  27.6 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.71 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  28.37 
 
 
340 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  24.65 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  32.3 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  25.43 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  25.46 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  28.34 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  26.84 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  28.73 
 
 
311 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.88 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1282  periplasmic binding protein  24.24 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.88 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  23.13 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  23.13 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  26.85 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  26.64 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.64 
 
 
306 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  28.68 
 
 
301 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  24.85 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  25.85 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  26.01 
 
 
306 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  26.23 
 
 
289 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  28.52 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.83 
 
 
483 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.79 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1370  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0381194  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  22.81 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  27.05 
 
 
314 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.05 
 
 
314 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  27.05 
 
 
314 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  27.05 
 
 
314 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  22.84 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.05 
 
 
314 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.86 
 
 
314 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.86 
 
 
314 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.86 
 
 
314 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.86 
 
 
314 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  26.77 
 
 
314 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  28.05 
 
 
316 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  24.61 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>