56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1011 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  852    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  55.17 
 
 
433 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  38.34 
 
 
499 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  41.84 
 
 
517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  34.73 
 
 
528 aa  116  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  34.85 
 
 
526 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  37.81 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  29.55 
 
 
517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  29.55 
 
 
517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  29.64 
 
 
517 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  32.34 
 
 
468 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  35.37 
 
 
580 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  42.35 
 
 
341 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  42.35 
 
 
341 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  33.18 
 
 
655 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  34.29 
 
 
588 aa  103  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  32.06 
 
 
540 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  33.19 
 
 
533 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  32.92 
 
 
502 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  33.33 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  33.33 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  33.64 
 
 
542 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  33.64 
 
 
542 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  33.64 
 
 
542 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  29.49 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  30.13 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  32.37 
 
 
494 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  28.02 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  32.68 
 
 
768 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  26.51 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  27.14 
 
 
518 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0429  hypothetical protein  37.23 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0166778  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0420  hypothetical protein  37.23 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  28.57 
 
 
421 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  24.43 
 
 
529 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  24.43 
 
 
529 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  30.07 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  28.72 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  30.07 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  30.07 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  27.13 
 
 
423 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  33.12 
 
 
435 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  26.21 
 
 
527 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  28.88 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  27.88 
 
 
783 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  27.78 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  27.96 
 
 
410 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  26.97 
 
 
432 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  30.87 
 
 
479 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  29.79 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  29.92 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  29.91 
 
 
898 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  27.66 
 
 
377 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  27.66 
 
 
377 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>