26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0004 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0004  RNA polymerase, dimerisation  100 
 
 		 91 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.627074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1439  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  46.67 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  42.86 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2336  RNA polymerase, dimerisation  35.87 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.37963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1793  RNA polymerase dimerization  38.3 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0620  RNA polymerase dimerisation  42.5 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00678824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0627  RNA polymerase dimerisation  35.11 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1248  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  37.65 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000851201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3577  RNA polymerase dimerization  37.97 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2581  RNA polymerase dimerisation  35.56 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1274  RNA polymerase dimerisation  32.97 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.943087  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0190  RNA polymerase dimerisation  34.78 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.388053  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1539  DNA-directed RNA polymerase subunit L  34.15 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.111893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0484  RNA polymerase, dimerisation  37.21 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2168  RNA polymerase, dimerisation  35.63 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1961  RNA polymerase dimerisation  37.97 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1264  RNA polymerase dimerisation  30.43 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.818462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1412  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  29.35 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0692  RNA polymerase dimerisation  30.43 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202688  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1862  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  32.58 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62535  RNA polymerase II core subunit  40 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185842  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1268  RNA polymerase dimerization  30.23 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04269  DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11a, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03860)  34.21 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00540677 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30435  predicted protein  30.23 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1802  DNA-directed RNA polymerase subunit L  31.65 
 
 		 89 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.20562  normal  0.258575 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1383  DNA-directed RNA polymerase subunit L  30.67 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0489721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>