11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1412 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1412  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  100 
 
 		 96 aa  189  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1264  RNA polymerase dimerisation  98.96 
 
 		 96 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.818462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0692  RNA polymerase dimerisation  96.88 
 
 		 96 aa  184  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202688  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1274  RNA polymerase dimerisation  75 
 
 		 95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.943087  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0190  RNA polymerase dimerisation  60.64 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.388053  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1862  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  34.41 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.794833 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1268  RNA polymerase dimerization  40.82 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  30.68 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0627  RNA polymerase dimerisation  25 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1961  RNA polymerase dimerisation  27.27 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1439  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  30.68 
 
 		 91 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>