12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0692 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0692  RNA polymerase dimerisation  100 
 
 		 96 aa  190  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202688  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1264  RNA polymerase dimerisation  97.92 
 
 		 96 aa  185  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.818462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1412  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  96.88 
 
 		 96 aa  184  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1274  RNA polymerase dimerisation  72.92 
 
 		 95 aa  142  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.943087  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0190  RNA polymerase dimerisation  60.64 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.388053  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1862  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  36.36 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.794833 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1268  RNA polymerase dimerization  30.53 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  31.82 
 
 		 92 aa  42.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30435  predicted protein  24.39 
 
 		 100 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0627  RNA polymerase dimerisation  25 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04269  DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11a, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03860)  30.26 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00540677 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1961  RNA polymerase dimerisation  27.54 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>