13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04269 on replicon BN001302
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_04269  DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11a, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03860)  100 
 
 		 129 aa  269  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00540677 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62535  RNA polymerase II core subunit  44.54 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35735  predicted protein  40.74 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0691994  normal  0.967834 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02280  DNA-directed RNA polymerase ii 13.3 kda polypeptide, putative  37.04 
 
 		 162 aa  92  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17103  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47430  predicted protein  41.44 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1862  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  42.47 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.794833 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1268  RNA polymerase dimerization  41.67 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65363  RNA polymerase I and III subunit  32.47 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.285306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12779  predicted protein  48.98 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0776708  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06558  DNA-directed RNA polymerase I and III 14 KDA polypeptide (AFU_orthologue; AFUA_6G04610)  30.77 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01370  DNA-directed RNA polymerase, putative  43.75 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.291062  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30435  predicted protein  44.9 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0692  RNA polymerase dimerisation  30.26 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>