15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30435 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30435  predicted protein  100 
 
 		 100 aa  203  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06558  DNA-directed RNA polymerase I and III 14 KDA polypeptide (AFU_orthologue; AFUA_6G04610)  38.71 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65363  RNA polymerase I and III subunit  37.97 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.285306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12779  predicted protein  41.67 
 
 		 89 aa  67  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0776708  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35735  predicted protein  35.35 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0691994  normal  0.967834 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01370  DNA-directed RNA polymerase, putative  35.53 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.291062  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47430  predicted protein  31.11 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04269  DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11a, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03860)  44.9 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00540677 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02280  DNA-directed RNA polymerase ii 13.3 kda polypeptide, putative  33.9 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17103  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62535  RNA polymerase II core subunit  30.59 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1862  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  36.54 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1274  RNA polymerase dimerisation  27.38 
 
 		 95 aa  43.5  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.943087  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  28.09 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0692  RNA polymerase dimerisation  24.39 
 
 		 96 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202688  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1268  RNA polymerase dimerization  28.09 
 
 		 92 aa  40.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>