13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_35735 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009361  OSTLU_35735  predicted protein  100 
 
 		 115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0691994  normal  0.967834 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47430  predicted protein  47.46 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02280  DNA-directed RNA polymerase ii 13.3 kda polypeptide, putative  42.86 
 
 		 162 aa  97.1  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17103  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04269  DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11a, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03860)  40.74 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00540677 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62535  RNA polymerase II core subunit  41.67 
 
 		 122 aa  94.7  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185842  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01370  DNA-directed RNA polymerase, putative  46.27 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.291062  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65363  RNA polymerase I and III subunit  37.8 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.285306  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06558  DNA-directed RNA polymerase I and III 14 KDA polypeptide (AFU_orthologue; AFUA_6G04610)  35.96 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336636  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1268  RNA polymerase dimerization  36.25 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30435  predicted protein  35.35 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1862  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  34.15 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12779  predicted protein  43.75 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0776708  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0364  Fis family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>