14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0364 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0364  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0819  DNA-directed RNA polymerase subunit L  39.24 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2053  DNA-directed RNA polymerase subunit L  38.75 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1268  RNA polymerase dimerization  38.16 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1589  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  36.49 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1862  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  40.48 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1802  DNA-directed RNA polymerase subunit L  31.03 
 
 		 89 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.20562  normal  0.258575 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1539  DNA-directed RNA polymerase subunit L  36.62 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.111893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0484  RNA polymerase, dimerisation  35.9 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2581  RNA polymerase dimerisation  40.68 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35735  predicted protein  39.13 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0691994  normal  0.967834 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62535  RNA polymerase II core subunit  37.68 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47430  predicted protein  42.65 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1248  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  29.33 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000851201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>