12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0484 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0484  RNA polymerase, dimerisation  100 
 
 		 91 aa  184  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2581  RNA polymerase dimerisation  67.82 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2336  RNA polymerase, dimerisation  57.3 
 
 		 92 aa  105  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.37963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1248  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  55.68 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000851201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2168  RNA polymerase, dimerisation  44.83 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1439  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  32.22 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  35.14 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0364  Fis family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0004  RNA polymerase, dimerisation  35.56 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.627074  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1539  DNA-directed RNA polymerase subunit L  28.41 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.111893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1802  DNA-directed RNA polymerase subunit L  24.71 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.20562  normal  0.258575 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0620  RNA polymerase dimerisation  31.76 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00678824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>