20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1439 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1439  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  100 
 
 		 91 aa  180  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  53.33 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0004  RNA polymerase, dimerisation  46.67 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.627074  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0620  RNA polymerase dimerisation  48.15 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00678824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0627  RNA polymerase dimerisation  37.23 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1793  RNA polymerase dimerization  39.36 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3577  RNA polymerase dimerization  43.42 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2336  RNA polymerase, dimerisation  33.7 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.37963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2581  RNA polymerase dimerisation  37.78 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1961  RNA polymerase dimerisation  36.25 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0484  RNA polymerase, dimerisation  32.22 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1539  DNA-directed RNA polymerase subunit L  28.05 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.111893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1802  DNA-directed RNA polymerase subunit L  32.93 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.20562  normal  0.258575 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1248  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  30.34 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000851201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62535  RNA polymerase II core subunit  38.81 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1274  RNA polymerase dimerisation  34.12 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.943087  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1264  RNA polymerase dimerisation  32.56 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.818462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0190  RNA polymerase dimerisation  31.52 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.388053  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1383  DNA-directed RNA polymerase subunit L  34.67 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0489721  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1412  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  30.68 
 
 		 96 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>