14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2336 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2336  RNA polymerase, dimerisation  100 
 
 		 92 aa  191  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.37963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0484  RNA polymerase, dimerisation  57.3 
 
 		 91 aa  105  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2581  RNA polymerase dimerisation  55.06 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1248  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  43.82 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000851201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2168  RNA polymerase, dimerisation  45.98 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1439  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  33.7 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  28.92 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0004  RNA polymerase, dimerisation  35.87 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.627074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1793  RNA polymerase dimerization  29.79 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3577  RNA polymerase dimerization  32.89 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0627  RNA polymerase dimerisation  27.66 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1961  RNA polymerase dimerisation  41.94 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02280  DNA-directed RNA polymerase ii 13.3 kda polypeptide, putative  29.49 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17103  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0620  RNA polymerase dimerisation  32.5 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00678824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>