16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0627 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0627  RNA polymerase dimerisation  100 
 
 		 95 aa  188  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1961  RNA polymerase dimerisation  79.27 
 
 		 94 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1793  RNA polymerase dimerization  71.28 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0620  RNA polymerase dimerisation  65.59 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00678824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3577  RNA polymerase dimerization  71.08 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1439  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  37.23 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  36.17 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1274  RNA polymerase dimerisation  34.85 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.943087  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2336  RNA polymerase, dimerisation  27.66 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.37963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0004  RNA polymerase, dimerisation  35.11 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.627074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1248  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  26.09 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000851201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0190  RNA polymerase dimerisation  26.67 
 
 		 95 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.388053  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1268  RNA polymerase dimerization  39.53 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1412  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  25 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0692  RNA polymerase dimerisation  25 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202688  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1264  RNA polymerase dimerisation  25 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.818462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>